در شش كيلومتري مركز شهر قم كوهي وجود دارد كه از فراز آن ميتوان همه شهر را با يك نگاه طي كرد. اين كوه منسوب به حضرت خضر(ع) با قدمت سه هزار سال است.
ميگويند بر قله اين كوه در سه هزار سال پيش غاري بوده است كه حضرت خضر (ع) در آن غار به عبادت و نيايش ميپرداخت، غاري كه امروز به مسجد كوچكي تبديل شده است و سالها پيش از اين در حالي كه هنوز قم آنقدر بزرگ نشده بود كه خود را به دامنه اين كوه برساند معبد عارفان و سالكان و اوتاد بود، خلوت كدهاي براي شب زندهداري و عبادت عالمان و عاشقان طريقت حق؛
استاد مجاهدي نقل مي کنند:
هنگامي كه حضرت آقاي مجتهدي در قم اقامت داشتند با مسجد مقدس جمكران و كوه خضر بسيار مأنوس بودند. در آن زمان هنوز مسجد همان حالت قديمي خود را داشت و معنويت عجيبي بر فضاي آن حاكم بود و ايشان مي فرمودند:
مسير عبور حضرت ولي عصر – ارواحنا فداه – از زميني كه مسجد مقدس جمكران در آن واقع است هنوز روشن و عطرآگين است و جان آدمي را مينوازد و آدمي را به خضوع و خشوع وا ميدارد،
برزميني كه نشان كف پاي تو بود
سالها سجده صاحبنظران خواهد بود
كوه خضر نيز از اماكن مورد علاقه ايشان بود و در آن جا خلوت ميكردند و به دعا و توسل مي پرداختند. آن سال تصميم گرفتهبودند كه اربعيني را در كوه خضر سپري كنند و لذا ده روز پيش از فرا رسيدن ماه مبارك رمضان به كوه خضر رفتند و در اتاقي كه در آن جا بود ساكن شدند و ارتباطشان را جز با معدودي از دوستان قطع كردند... .
در روايات اسلامي نیز بر قداست کوهي سفيد که در اطراف قم و به نزديکي دهي کهن که در جنب مسجدي است و جمکران نام دارد تاکيد شده است. همان کوهي که به کوه خضر شهرت دارد و گويند پرچم قائم آل محمد "عج" را هنگام ظهور در آن مکان برافرازند مكاني كه امروز به مسجدگاهي براي عامه بدل گشته است و تفرجگاهي مذهبي براي زائران اين شهر و جايي براي كسب معنويت است. از طرفی رونق آن از علائم نزديكي ظهور حضرت مهدي(عج) است نه این که حضرت از آنجا ظهور کنند؛ در حديث معتبري از اميرالمؤمنين علي(علیه السلام) نقل شده است كه ساخت مسجدي را در كنار كوه خضر كه پايگاهي براي ياران امام موعود(ع) است خبر ميدهد. اين حديث شريف كه كلمه جمكران را نيز به همراه دارد در كتاب انوارالمشعشعين، ج 1، ص 454 فصل 10، نور سوم به طور مفصل نقل و شرح شده است.

